Instytut został powołany rozporządzeniem Rady Ministrów z dnia 21 marca 1979. Do 1 stycznia 2020 nosił nazwę Instytut Kardiologii im. Prymasa Tysiąclecia Stefana Kardynała Wyszyńskiego. Współpracuje z czołowymi ośrodkami krajowymi i zagranicznymi w Europie i w USA. Działalność kliniczna obejmuje cały kraj. Instytut przyczynił się do rozwoju polskiej kardiologii i kardiochirurgii, szczególnie przez implementację nowoczesnych metod leczenia i rehabilitacji pacjentów.